Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms