Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX11P35716 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX11P35716 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX11P35716 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX11P35716 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX11P35716 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX11P35716 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX11P35716 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX11P35716 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX11P35716 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX11P35716 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX11P35716 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX11P35716 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX11P35716 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX11P35716 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX11P35716 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX11P35716 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX11P35716 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX11P35716 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX11P35716 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX11P35716 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX11P35716 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms