Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER1P34995 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms