Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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