Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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