Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CTSSP25774 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSSP25774 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSSP25774 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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CTSSP25774 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSSP25774 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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