Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms