Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRPH2P23942 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms