Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA5P20719 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms