Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms