Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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