Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms