Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPI1P17947 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms