Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3P08700 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3P08700 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IL3P08700 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms