Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms