Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBDO15205 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBDO15205 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBDO15205 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBDO15205 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBDO15205 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBDO15205 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBDO15205 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBDO15205 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBDO15205 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBDO15205 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms