Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
USP9YO00507 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP9YO00507 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms