Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms