Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms