Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms