Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C9orf92A6NGG3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms