Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms