Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD54BQ9Y620 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms