Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms