Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms