Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB9

AURKC, Aurora kinase C, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKCQ9UQB9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AURKCQ9UQB9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms