Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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