Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX7Q9UNH6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms