Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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