Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2IRD1Q9UHL9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms