Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms