Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms