Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHPF2Q9P2E5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHPF2Q9P2E5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHPF2Q9P2E5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHPF2Q9P2E5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHPF2Q9P2E5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms