Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms