Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms