Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms