Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HMG20AQ9NP66 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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