Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms