Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms