Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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