Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms