Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms