Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms