Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms