Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms