Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms