Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms