Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALPK3Q96L96 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALPK3Q96L96 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms