Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms