Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms